Župnijska farna cerkev Sv. Marjete je bila zgrajena nedaleč od gradu Heilenstein, v sedanjem centru Polzele in se prvič omenja leta 1255. Lastniki gradu iz rodu Heilenstein so širili svoje posesti tudi v povezavi s posestmi celjskih grofov. Prvotna cerkev je bila romanska. Leta 1263 je postala komendatorska cerkev, o čemer priča relief malteškega križa na stropu v prezbiteriju. V teku stoletij so jo večkrat prezidali, najbolj korenito leta 1616, ko je dobila sedanjo obliko. Romansko stavbo so barokizirali in ji prizidali sedanji prezbiterij, obe kapeli in zakristijo; zvonik so dvignili za eno nadstropje, sicer je ohranil svojo gotsko zasnovo.

Zanimivost cerkve je relikvija sv. Teodorja, ki jo je iz Rima za cerkev pridobil komtur Helfenthal. Steklena krsta, v kateri je na rdečem žametu ležalo truplo sv. Teodorja, oblečeno v dragoceno, z zlatom in srebrom okrašeno obleko, je bila najprej v cerkvi na Gori Oljki. Ko je bila zaradi jožefinskih reform leta 1788 izdana odločba o zaprtju cerkve, so relikvije sv. Teodorja prenesli na Polzelo.